折耳貓除了無可避免的遺傳性骨骼病外,還有以下疾病常見于它們身上:
1. 呼吸系統毛病:骨骼病變的基因除影響手腳的骨骼外,亦會影響身體其它部份軟骨組織發育異常。較常見的是呼吸管道收窄引起呼吸不暢順,嚴重者需施以外科手術來擴闊呼吸管道。此外會有噴鼻血的問題,不過成因暫時未明和未有方法醫治。
2. 體質較弱 :曾有病例,貓咪的體形及體重只有正常貓的三份之二,更曾感染貓瘟、皮膚病、過敏等毛病。
3. 心臟病:心肌肥大癥也是常見于折耳貓身上,不過一般是很難發現,直到出現病征時,已有生命危險,貓咪需要控制飲食和終生服藥。