日本731部隊的罪行在戰爭結束后被逐漸曝光和發現。其中最關鍵的推動力量,是一些獨立調查機構和個人的努力。
首先,1945年8月日本正式宣布投降,隨著戰爭的結束,蘇聯紅軍進入了中國東北地區。蘇聯士兵在哈爾濱等地發現了日本設立的細菌戰實驗室和試驗場,從而證實了731部隊存在和活動的真實性。
其次,1949年,中華人民共和國成立后,中國政府開始正式調查日本在中國東北地區的罪行。1952年,中國政府成立了專門的調查機構,展開了大規模的調查和審判工作,揭露出了731部隊的嚴重罪行。
最后,在日本戰敗后,美國政府也在一定程度上參與了對于日本731部隊的調查,司法審判等工作。近年來,日本政府也多次對于731部隊進行了正式的譴責和道歉。