以羅馬教會為中心的西歐基督教正統教派,在蠻族大遷徙的狂風暴雨中同羅馬帝國一樣面臨著滅頂之災。日耳曼部落除法蘭克外,都已接受基督教的異端阿利安教派。
而高盧居民信奉的是正統的羅馬基督教會,經濟文化發展水平比日耳曼族較高。因此,在新征服者與當地人民之間,矛盾尖銳。日耳曼部落對代表羅馬帝國利益、本身又占有大量土地的基督教會抱著敵視態度,剝奪了教會的廣大田產。在西歐高盧,許多主教、教士逃亡,教會無力恢復活動。
西哥特王阿拉力克曾三圍羅馬城,下令蠻軍在羅馬城內大搶六天蠻軍在城內燒殺搶掠、奸淫殺戮,無惡不作。所有貴族豪富的家中動產,都被搬到蠻軍的輜重車上,每個富豪家中的金銀珠寶,也被洗劫一空。每當蠻兵進入一所豪華邸宅,如果搶不到什么金銀珠寶,就抓住主人加以嚴刑拷打,一直打到交出財寶為止,否則就有被全家處斬的危險。羅馬城內的所有富豪之家,經這一場蠻族的兵燹之災,都在一朝之間從家資萬貫而變成一無所有的乞丐。東哥特王國狄奧多里下令鎮壓羅馬的天主教徒,凡是抗命不納稅的天主教徒,一律施以嚴刑拷打,并且游街宣布其罪狀。
同時為了防范羅馬天主教的叛亂,下令意大利羅馬籍臣民,除了家庭用的小刀之外,不得藏有其他任何武器。狄奧多里晚年更加殘酷地迫害天主教,曾把教皇約翰一世囚死在獄中,禁止意大利境內的天主教傳教,把所有教堂都全部交由阿利安派教徒接受。