裙帶菜配子體在性成熟階段,可以形成精子囊和卵囊,進而分別產生精子和卵子。所以,我們可根據形成卵囊或精子囊或二者兼有來確切判斷其性別,在營養生長階段:
因此可以根據上述形態特點判別雌性與雄性配子體。

此外,海藻種質庫的研究人員發現了裙帶菜雌性特異的 DNA 分子標記,可用于檢驗配子體的性別。
此外,法國的研究人員還開發了雌性裙帶菜與雄性裙帶菜特異的 DNA 標記。
由于處于營養生長階段的配子體的形態受環境影響較大,因此利用 DNA 性別特異標記能夠更準確地鑒定性別。但是 DNA 分子標記不能完全解決判斷雌雄同體性別的問題,因為雌雄同體配子體只具有雄性特異的 DNA 標記,所以用 DNA 分子標記法只能輔助檢測雌雄同體性別表型。